Solutions technique

Intégration et valorisation des données sous un modèle unique

1. Extraction, harmonisation et pseudonymisation des données

Nous extrayons les données sous tout format et provenant de toutes les sources de votre système d’information hospitalier. Des comptes-rendus aux prescriptions en passant par l’imagerie et l’anatomopathologie ou la génétique. Ces données sont ensuite harmonisées sous un modèle de données unique facilement exploitable pour la recherche et compatible avec OMOP. Enfin, toutes les données chargées dans l’entrepôt sont pseudonymisées, conformément aux exigence de la CNIL.

“ Je remercie les équipes codoc pour leur connaissance et leur expertise dans la gestion de bases de données ”

Stéphane Sanchez

DIM CH Troyes

2. Valorisation des données extraites

Notre pipeline d’extraction de concepts médicaux est fondé sur un modèle symbolique, fruit de 10 ans de R&D, unique en France. Nous sommes capable d’enrichir vos documents non-structurés en détectant et en restructurants les concepts présents dans les comptes-rendus. Ces concepts peuvent ensuite être utilisés pour la recherche : ils facilitent la recherche dans les documents et permettent d’effectuer de nombreux traitements. Nous sommes aujourd’hui capables de qualifier les affirmations, les négations, ce qui relève des antécédents du patient pour les observations, les diagnostics, les examens...

Déploiement des projets de recherche

3. Gestion des projets et des accès

Grâce à une interface intuitive pour la gestion des projets de recherche, les chercheurs peuvent soumettre leur projet et demander accès aux données. La DRCI et le CSE-EDS peuvent valider ces projets, demander des informations complémentaires, provisionner et auditer les accès internes et externes aux données des différentes études. Chaque projet est constitué avec l’architecture technique adaptée, d’un espace de travail minimal pour les plus petits projets, jusqu’à des machines dédiées équipées de GPUs pour les projets d’apprentissage automatisé gourmands en ressources.

4. Information des patients et gestion des oppositions

Avant d’entamer le traitement des données dans le cadre de l’étude, informez facilement vos patients de la réutilisation de leurs données médicales et collectez leur éventuelle opposition grâce à notre plateforme de gestion du consentement. Cette plateforme, connectée à l’entrepôt, permet d’exclure automatiquement les patients ayant formulé une opposition et, à l’inverse, d’informer automatiquement les patients dès leur inclusion à une étude. Ils peuvent ainsi consulter la liste des projets réutilisant leurs données : cette transparence est un gage de bonne conduite de la recherche dans votre établissement.

Exploitation des données dans des espaces de travail

5. Mise à disposition des données dans des espaces de travail

Les données nécessaires au bon déroulement du projet sont mises à disposition dans une bulle sécurisée, hébergée dans le parc informatique de votre établissement ou dans un cloud privé certifié HDS. Ces bulles sécurisées hébergent les espaces de travail des différents projets de l’établissement. Elles se déploient à la volée depuis l’interface de gestion des études de l’établissement. En cas d’inactivité prolongée, elles sont mises en veille afin de préserver les ressources informatiques de l’entrepôt. Adaptez facilement les ressources assignées à chaque projet.

6. Manipulation des données et collaboration

Chaque espace de travail embarque un ensemble d’outils permettant le bon traitement des données afin de répondre à l’objet de l’étude. L’application Dr. Warehouse permet la fouille des données, des logiciels de traitement des données tels que Jupyter ou R Studio sont également mis à disposition des chercheurs et il est possible d’ajouter des solutions propriétaires dans certains espaces de travail. Accordez et retirez à la volée des accès externes pour les techniciens qui doivent participer à votre projet.

Notre environnement technique à votre service

Le déploiement d’espaces de travail à la volée pour les projets de recherche permet le bon traitement des données dans des espaces sécurisés dont vous contrôlez les accès.

Intégration des données

Déploiement d’espaces de travail

On-premise, cloud privé HDS, ou les deux